El control de plagas dípteros es importante porque, a parte de que su sola presencia produce molestias al ganado y a las personas, son transmisores de patógenos que producen enfermedades. Sus hábitos alimenticios y reproductivos provocan que transporten en sus patas microorganismos desde las heces  hasta los alimentos donde se posan.

Además, las propias heces de las moscas y sus vómitos pueden contener bacterias resistentes a su actividad digestiva. De esta forma las personas al ingerir estos alimentos contaminados pueden contraer enfermedades como la disentería, el cólera y la fiebre tifoidea.

Especies de interés: Mosca doméstica (Musca domestica), mosca de la fruta (Drosophyla melanogaster), mosca de la carne (Calliphora erytrocephala, Lucilia caesar y L. sericata), mosca de la humedad (Psychoda sp.) y mosca negra (Simuliidae).